Notranja pudendalna arterija se odcepi od notranje ilijačne arterije in dovaja kisikovo kri v zunanje genitalije moških in žensk. Vendar pa je zaradi spola nekaj anatomskih razlik.
Arterija je pri ženskah običajno manjša. Tudi nekatere veje arterije so značilne za spol. Pri moških veje te arterije vključujejo hrbtno in globoko arterijo penisa, ženske pa hrbtno in globoko arterijo klitorisa. Ženske imajo zadnje labialne veje, moški pa mošnice. Iz te arterije obstajajo tudi druga plovila, značilna za genitalije.
Spodnje rektalne in presredke arterije, ki se odcepijo od notranje pudendalne arterije, so pri obeh spolih enake.
